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SNDS — Données médico-administratives

Magellan

Première infrastructure privée de données médico-administratives en France. Du protocole à la publication en 8 à 12 mois.. Construit sur le SNDS (Délibération CNIL n°2025-006 du 27 janvier 2022), données déjà extraites et structurées. Bac à sable CNIL actif depuis mai 2021. Enrichi par le pipeline Victoria et nos algorithmes de phénotypage.

65M
Bénéficiaires SNDS
233
Variables sélectionnées (7-8% du SNDS)
10 ans
Fenêtre glissante
7 mois
vs 23 mois voie standard
Pourquoi Magellan

Trois piliers, zéro compromis

Des preuves en vie réelle en mois, pas en années. Les données sont déjà extraites : après accord CESREES/CNIL, les analyses démarrent immédiatement.

Rapidité

Données SNDS déjà extraites et structurées par le pipeline Victoria. Après accord CESREES/CNIL, pas d'attente d'extraction CNAM : les analyses démarrent directement.

7 mois vs 23 mois voie standard
Fenêtre glissante de 10 ans
Délibération CNIL n°2025-006
Pas d'extraction CNAM à attendre

Couverture

99% de la population française couverte. DCIR + PMSI + Vaccin-Covid. 266 variables sélectionnées pour une granularité maximale, réduites à 161 variables (2-3%) dans la datalake Magellan — privacy by design.

65M bénéficiaires
266 variables sélectionnées
DCIR + PMSI + Vaccin-Covid
13 aires thérapeutiques couvertes

Conformité

Clinityx prend en charge l'ensemble du parcours réglementaire (CESREES, CNIL). Privacy by design : minimisation des données, contrôle d'entropie, contrôle du risque d'inférence, bruitage ±10 patients. Seuls des indicateurs agrégés et anonymisés sont livrés. Seuil minimum de 11 individus par agrégat.

Minimisation des variables (266 → 161)
Bruitage ±10 patients sur tous les comptages
Contrôle d'entropie et de risque d'inférence
Seuil min. 11 individus/agrégat
Avantage temps

Des preuves en mois,
pas en années

L'accès standard au SNDS prend environ 23 mois. Avec Magellan, les données sont déjà extraites et structurées : après accord CESREES/CNIL, les analyses démarrent immédiatement sans attendre l'extraction CNAM.

Voie standard

CESREES & CNIL
4 mois
Extraction CNAM
14 mois
Analyses
5 mois
Durée totale 23 mois

Voie Magellan

CESREES & CNIL
4 mois
Extraction CNAM
Immédiat
Analyses
3 mois
Durée totale 7 mois
-16 mois
de gain par rapport à la voie standard — mêmes étapes réglementaires, mais les données sont déjà extraites et structurées
Couverture & volumétrie

Une vue exhaustive des parcours de soins

Magellan exploite les données du SNDS pour offrir une couverture nationale de 65 millions de bénéficiaires, avec un historique profond et une granularité individuelle.

Population couverte

Ensemble des bénéficiaires du régime général de l'Assurance Maladie. Données longitudinales anonymisées avec suivi individuel.

65M bénéficiaires

Profondeur historique

Fenêtre glissante de 10 ans de consommation de soins. Suivi longitudinal des parcours patients avec mise à jour continue.

10 ans fenêtre glissante

Dispensations en officine

Tous les remboursements de médicaments (ville et hôpital). Classification ATC, posologie, durée de traitement, adhérence.

100% des dispensations remboursées

Hospitalisations (PMSI)

Séjours hospitaliers publics et privés via le chaînage au PMSI. Diagnostics CIM-10 principaux et associés, actes CCAM.

PMSI chaîne individuellement

Affections Longue Durée

Toutes les ALD actives avec diagnostics CIM-10. Identification des pathologies chroniques et suivi de la comorbidité.

ALD diagnostics CIM-10

Phénotypage avancé

Algorithmes propriétaires Clinityx pour l'identification de cohortes, les lignes de traitement, les scores de comorbidité et les parcours de soins. 266 variables sélectionnées du SNDS, 161 dans la datalake Magellan.

233 variables sélectionnées (7-8% du SNDS)
Variables disponibles

Des données granulaires et longitudinales

Magellan donne accès à l'ensemble des flux de remboursement du SNDS, structurés et enrichis par nos algorithmes de phénotypage.

Catégorie Détail Disponible
Démographie Age, sexe, région, commune (IRIS), régime AMO, CMU-C, indice de défavorisation ✓
Médicaments ATC 7 niveaux, DCI, dosage, forme, nombre de boites, date de dispensation, prescripteur ✓
Consultations Médecin généraliste, spécialiste, nature d'acte, code CCAM, date, montant remboursé ✓
Hospitalisations GHM, diagnostics CIM-10 (DP/DR/DAS), actes CCAM, durée de séjour, type d'établissement ✓
ALD & Pathologies Codes CIM-10 des ALD actives, date de début, pathologies chroniques identifiées ✓
Biologie Actes de biologie médicale (codes NABM), date et montant. Pas de résultats quantitatifs. ✓
Dispositifs médicaux LPP (liste des produits et prestations), date de délivrance, montant ✓
Phénotypage Algorithmes propriétaires Clinityx : identification de cohortes, scores de comorbidité, lignes de traitement ✓
Décès Date de décès (CepiDC chaîné), cause de décès (quand disponible) ✓
Privacy by design

Minimisation progressive des données

Magellan applique une stratégie de minimisation des données en trois étapes, conformément aux principes de privacy by design et aux recommandations CNIL.

Étape 1 : Sélection des variables
Magellan a sélectionné 266 variables sur les ~3000 disponibles dans le SNDS (8-9%). Seules les variables strictement nécessaires pour les analyses sont extraites.
Étape 2 : Réduction dans la datalake
La datalake Magellan réduit ces 266 variables à 161 variables (2-3% du SNDS). Cette réduction garantit un accès minimal aux données brutes.
Étape 3 : Contrôles de divulgation
Seuls des indicateurs agrégés et anonymisés sont livrés. Seuil minimum de 11 individus, bruitage ±10 patients sur tous les comptages, contrôle d'entropie et de risque d'inférence.
Mecanismes de protection
  • Minimisation des variables : 266 → 161 variables
  • Bruitage : ±10 patients sur tous les comptages
  • Contrôle d'entropie : vérification de la qualité des données diffusées
  • Contrôle de risque d'inference : Prévention de la réidentification
  • Seuil de divulgation : Minimum 11 individus par agrégat
  • Bac à sable CNIL : Actif depuis mai 2021, avant autorisation finale
Capacités d'études

Des études observationnelles robustes

Magellan permet de conduire toute la gamme des études pharmaco-épidémiologiques, du fardeau de la maladie (burden of disease) aux études post-inscription.

Prévalence & incidence

Estimation de la fréquence des pathologies à l'échelle nationale. Tendances temporelles, variations régionales.

Parcours de soins

Analyse des trajectoires patients : délais diagnostiques, séquences de traitements, switch, augmentation.

Fardeau de la maladie

Fardeau économique et clinique des pathologies. coûts directs, comorbidités, hospitalisations évitables.

Efficacité en vie réelle

Comparaison de stratégies thérapeutiques en conditions réelles. Propensity score, IPTW, analyses de survie.

Sécurité & pharmacovigilance

Détection de signaux de sécurité. Risques associés aux traitements, événements indésirables, comparaison active.

Médico-économique

Coût-efficacité, budget impact, études post-inscription pour les dossiers HAS/CEPS et négociations de prix.

Chronologie

5 phases pour accélérer votre étude

Du protocole au manuscrit, nous pilotons chaque étape avec expertise et transparence.

1

Faisabilité

Validation de la question de recherche et des données disponibles.

2-4 sem

2

Protocole & Réglementaire

Rédaction du protocole et préparation des dossiers CNIL.

8-12 sem

3

Extraction SNDS

Extraction et qualification des données depuis le SNDS.

4-6 sem

4

Analyse statistique

Préparation et analyses selon le protocole validé.

8-12 sem

5

Rapport & Publication

Rédaction du rapport et support pour la publication.

4-6 sem

Études réalisées

Des projets concrets, publiés sur Semaphore

Chaque étude Magellan est documentée sur notre portail de transparence. Voici quelques exemples de projets menés sur l'EDS Magellan.

Pneumologie — Boehringer Ingelheim

REPEAT — Persistance des antifibrotiques en vie réelle

Étude de la persistance des traitements antifibrotiques dans la fibrose pulmonaire idiopathique. Autorisation CNIL DR-2024-183.

Partenaire : Boehringer Ingelheim France
Cardiologie — Edwards Lifesciences

Vitale — Valves aortiques transcatheter

Évaluation des outcomes à long terme après implantation de valve aortique transcatheter (TAVI) sur la population française.

Partenaire : Edwards Lifesciences
Vaccination — Pfizer

Covid — Suivi vaccinal en vie réelle

Analyse de la couverture vaccinale, des schémas de vaccination et du suivi post-vaccinal Covid-19 sur les données SNDS.

Partenaire : Pfizer
Dispositifs médicaux

Mesh BSU — Bandelettes sous-urétrales

Quantification à moyen terme du taux de réintervention pour complication et pour récidive après implantation de BSU sur l'ensemble de la population française.

Semaphore : Magellan Mesh — BSU →
Infrastructure

Pipeline Victoria

Le moteur de traitement qui transforme les données SNDS brutes en variables structurées et exploitables. Méthodologie publiée et revue par les pairs.

Linéarisation & nettoyage

Déduplication, validation, gestion des chevauchements DCIR/PMSI et des splits de facturation.

Tables structurées (7 entités)

Production d'entités exploitables : CCAM, CIM-10, LPP, Médicaments (avec DDD), UM, Patients, Consultations, Actes Biologiques, ALD, GHM. 266 variables sélectionnées.

Contrôles qualité intégrés

4 familles de cleaners automatisés. Chaîne de transformation auditable de bout en bout. Validation sur cohortes de référence (70M patients Magellan).

Privacy by design

Les données ne quittent jamais l'enclave sécurisée. Minimisation progressive : 233 → 161 variables. Rétention max : fenêtre glissante de 10 ans.

Publication scientifique

Méthodologie Victoria publiée et revue par les pairs

Pipeline de traitement du SNDS pour la recherche pharmaco-épidémiologique. Publié dans le Journal of Health Informatics et indexé sur PubMed.

DOI 10.1177/14604582251318250 · PubMed PMID 39913942
Flux de données
CNAM SNDS Fils Victoria MAGELLAN

266 variables sélectionnées → 161 variables · Requêtage · Analytique · Indicateurs agrégés · Privacy by design

Expérience Victoria
France TAVI
50k patients
Fresh
2,500 patients
Rhea Fresh
1.5M patients
IC SNDS
3.5M patients
Magellan
70M patients
Architecture technique

Du SNDS brut à l'évidence clinique

Un pipeline sécurisé en 5 étapes, de l'extraction des données à la livraison des résultats.

Étape 01

Extraction CNAM

Extraction des données brutes du SNDS via l'accès permanent autorisé par la CNIL.

Étape 02

Structuration

Pipeline Victoria : nettoyage, déduplication, linéarisation et structuration en 266 variables exploitables.

Étape 03

Datalake sécurisé

Stockage sur infrastructure HDS certifiée (cegedim.cloud). Données pseudonymisées, accès restreint.

Étape 04

Base minimisée

Extraction d'une base dédiée par projet. Seules les variables nécessaires au protocole sont accessibles.

Étape 05

Résultats

Indicateurs agrégés et anonymisés. Analyse de risque en réidentification en fin de projet pour garantir l'anonymat.

Cadre réglementaire

Un accès sécurisé et conforme

Magellan est opéré sous autorisation permanente de la CNIL (Délibération n°2025-006). Bac à sable CNIL actif depuis mai 2021, avant l'autorisation finale. Chaque étude fait l'objet d'un protocole dédié soumis au CESREES puis à la CNIL, avec information des patients via le portail Semaphore.

Délibération n°2025-006 (27/01/2022) Hébergement HDS Privacy by design Comité scientifique Semaphore (transparence)
Comité scientifique

Pr Mebazza (AP-HP) · Pr Zins (INSERM) · S. Combes (HDH) · Pr Gilard (CHU Brest) · et autres experts indépendants

1

Faisabilité

Évaluation de la question de recherche, dimensionnement de la cohorte, protocole préliminaire.

2

Déclaration CNIL

Constitution du dossier de demande d'autorisation avec évaluation CESREES puis accord CNIL.

3

Transparence

Publication de la fiche d'information patient sur le portail Semaphore (art. 14 RGPD).

4

Exécution

Extraction, analyse et livraison des résultats dans un environnement sécurisé HDS.

5

Livraison & archivage

Rapport d'étude, tables statistiques, archivage conforme. Support à la publication scientifique.

Différenciateurs

Magellan vs. accès standard au SNDS

Comparatif entre la voie Magellan et l'accès SNDS standard. Même périmètre réglementaire, mais un gain de temps décisif.

Critère Magellan (Clinityx) Voie standard
Délai jusqu'aux résultats ~7 mois ~23 mois
Accord CESREES / CNIL Requis — pris en charge par Clinityx Requis — à votre charge
Extraction CNAM Immédiat — données déjà extraites 14 mois
Données pré-extraites & structurées ✓ 266 variables ✗
Pipeline automatisé (Victoria) ✓ Publié & peer-reviewed ✗
Bénéficiaires couverts 65M (99% population) 100% (si autorisé)
Fenêtre de données Glissante 10 ans Sur demande
Hébergement HDS français ✓ cegedim.cloud CASD / Autre
Accompagnement réglementaire ✓ End-to-end (CESREES, CNIL, Semaphore) Auto-géré
Privacy by design ✓ Agrégés uniquement (seuil 11) Accès données individuelles
Portail de transparence ✓ Semaphore ✗
Projets autorisés CNIL (2025) 35+ —

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